Lisansüstü Eğitim Enstitüsü · Gıda Mühendisliği · Lisansüstü
Dersin Amacı
Moleküler gıda mikrobiyolojisi ile ilgili son gelişmeler hakkında bilgi sahibi olmak ve öğrenilen teknikleri spesifik mikroorganizma türlerine uygulayabilir durumda olmak
Ders İçeriği
DNA, RNA ve proteinlerle ilgili temel bilgiler, nükleik asitlerin izolasyonu ve agaroz jel elektroforezinde görüntülenmesi, polmeraz zincir reaksiyonu (PCR), real time PCR ve dizi analizi, mikroorganizmaların moleküler identifikasyonu, tiplendirilmesi ve filogenetik analizi
Zorunlu Kaynaklar
Thieman WJ ve Palladino MA (2013) Biyoteknolojiye Giriş. Çeviri Editörü: Mücella Tekeoğlu. Palme Yayıncılık
Buckingham L (2019) (Molecular Diagnostics: Fundamentals, Methods, and Clinical Applications
Önerilen Kaynaklar
Cadotte MW, Davies TJ (2016) Phylogenies in Ecology: A Guide to Concepts and Methods, Princeton University Press
Dersin Öğrenme Çıktıları
- DNA, RNA ve proteinlerle ilgili temel bilgilerin kazanılması
- Nükleik asit izolasyon teknikleri hakkında bilgi sahibi olmak
- Agaroz jel elektroforezi, PCR ve real time PCR hakkında bilgi sahibi olmak
- PCR'da kullanılabilecek primer tasarımı yapabilmek
- Dizilimlerin analizi ile ilgili yöntemler hakkında bilgi sahibi olmak
- Değişik mikroorganizmaların moleküler yöntemlerle nasıl tanımlanabileceğinin öğrenilmesi
- Mikroorganizma tiplendirme yöntemleri hakkında bilgi sahibi olmak
Temel Alan Dağılımı
Öğretim Yöntem ve Teknikleri
Ölçme ve Değerlendirme
AKTS / İş Yükü
| Etkinlik | Sayı | Süre (saat) | Toplam İş Yükü |
|---|---|---|---|
| Ders Süresi (Sınav Haftası Dahil) | 15 | 3 | 45 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi | 15 | 8 | 120 |
| Ara Sınav | 0 | 0 | 0 |
| Kısa Sınav | 0 | 0 | 0 |
| Ödev | 6 | 3 | 18 |
| Uygulama | 1 | 1 | 1 |
| Final | 1 | 1 | 1 |
Ders Akışı
| Hafta | Konu | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Moleküler Mikrobiyoloji-Giriş | Ders notları ilgili kısım |
| 2 | DNA, RNA ve proteinler | Ders notları ilgili kısım |
| 3 | Gen ekspresyon kontrolü ve mutasyonlar | Ders notları ilgili kısım |
| 4 | Nükleik asit izolasyon metotları | Ders notları ilgili kısım |
| 5 | Agaroz jel elektroforezi ve nükleik asitlerin analizi | Ders notları ilgili kısım |
| 6 | Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), real time PCR | Ders notları ilgili kısım |
| 7 | NCBI veritabanı ve primer tasarımı | Ders notları ilgili kısım |
| 8 | DNA dizi analizi, dizilerin görüntülenmesi, dizilerin veri tabanıyla karşılaştırılması (BLAST) | Ders notları ilgili kısım |
| 9 | Clustal - dizilerin hizalanması (alignment) | Ders notları ilgili kısım |
| 10 | Bakterilerin moleküler identifikasyonu | Ders notları ilgili kısım |
| 11 | Fungusların moleküler identifikasyonu | Ders notları ilgili kısım |
| 12 | Mikroorganizma tiplendirme yöntemleri | Ders notları ilgili kısım |
| 13 | Omik teknikler | Ders notları ilgili kısım |
| 14 | Genel değerlendirme / Proje sunumları | Dönem boyunca yürütülen çalışmalar |
| 15 | Final | Final |